Bazni par
Bazni par (eng. base pair, bp) mjerna je jedinica koja označava dvije dušikove baze međusobno vezane vodikovim vezama. Jedan bazni par odgovara približno 340 pm (3,4 Å)[1] duljine duž niti nukleinske kiselina, otprilike 618 ili 643 daltona za DNA i RNA.
Bazni parovi čine građevne blokove DNA i RNA. Diktirani specifičnim uzorcima gustoća elektronskih oblaka molekula dušikovih baza, Watson-Crickovi osnovni parovi (guanin-citozin i adenin-timin) omogućuju nukleinskim kiselinama održavanje pravilne strukture zavojnice.[2] Komplementarna priroda ove strukture temeljene na parovima osigurava suvišnu kopiju genetskih informacija kodiranih u svakom lancu DNA. Redovita struktura i redundantnost podataka koje pruža dvostruka zavojnica čini sustav pogodnim za pohranu genetskih informacija, dok spajanje baza između DNA i ulaznih nukleotida omogućava mehanizam putem kojeg polimeraza DNA replicira DNA, a polimeraza RNA prepisuje DNA u RNA. Mnogi proteini koji se vežu na DNA mogu prepoznati specifične obrasce uparivanja baza koji identificiraju određene regulatorne regije gena.
Sljedeće sekvencije DNA ilustriraju dvostruke nizove. Prema dogovoru, gornji pramen se piše od kraja 5' do kraja 3'. Na taj način se na donjem lancu piše 3 'do 5'.
Slijed DNA u bazi:
*ATCGATTGAGCTCTAGCG
*TAGCTAACTCGAGATCGC
Odgovarajuća RNA sekvencija, u kojoj je uracil supstituiran timinom:
*AUCGAUUGAGCUCUAGCG
*UAGCUAACUCGAGAUCGC
*kbp = kilo baznih parova = 1000 bp
*Mbp = mega baznih parova = 1 000 000 bp
*Gbp = giga baznih parova = 1 000 000 000 bp
- ↑ Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P. Prosinac 2014. Molecular Biology of the Cell. 6th izdanje. Garland Science, Taylor & Francis Group. New York/Abingdon. str. 177. ISBN 978-0-8153-4432-2
- ↑ Zhurkin VB, Tolstorukov MY, Xu F, Colasanti AV, Olson WK. 2005. Sequence-Dependent Variability of B-DNA. DNA Conformation and Transcription. str. 18–34. doi:10.1007/0-387-29148-2_2. ISBN 978-0-387-25579-8
- Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R. 2004. Molecular Biology of the Gene. 5th izdanje. Pearson Benjamin Cummings: CSHL Press (See esp. ch. 6 and 9)
- Sigel A, Sigel H, Sigel RK, ur. 2012. Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. Springer. doi:10.1007/978-94-007-2172-2. ISBN 978-9-4007-2171-5
- Clever GH, Shionoya M. 2012. Chapter 10. Alternative DNA Base-Pairing through Metal Coordination. Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. str. 269–294. doi:10.1007/978-94-007-2172-2_10. ISBN 978-94-007-2171-5. PMID 22210343
- Megger DA, Megger N, Mueller J. 2012. Chapter 11. Metal-Mediated Base Pairs in Nucleic Acids with Purine and Pyrimidine-Derived Neucleosides. Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. str. 295–317. doi:10.1007/978-94-007-2172-2_11. ISBN 978-94-007-2171-5. PMID 22210344
