PSMD9

PSMD9
Ідентифікатори
Символи	PSMD9, Rpn4, p27, proteasome 26S subunit, non-ATPase 9
Зовнішні ІД	OMIM: 603146 MGI: 1914401 HomoloGene: 2106 GeneCards: PSMD9
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • bHLH transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • proteasome regulatory particle • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • negative regulation of insulin secretion • убіквітин-залежний протеоліз • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • positive regulation of insulin secretion • protein deubiquitination • посттрансляційна модифікація • proteasome regulatory particle assembly • MAPK cascade • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of cellular amino acid metabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • Fc-epsilon receptor signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mRNA stability • T cell receptor signaling pathway • трансмембранний транспорт • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • interleukin-1-mediated signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • позитивна регуляція канонічного сигнального шляху Wnt • regulation of mitotic cell cycle phase transition • regulation of hematopoietic stem cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5715	67151
Ensembl	ENSG00000110801	ENSMUSG00000029440
UniProt	O00233	Q9CR00
RefSeq (мРНК)	NM_001261400 NM_002813	NM_026000
RefSeq (білок)	NP_001248329 NP_002804	NP_080276
Локус (UCSC)	Хр. 12: 121.89 – 121.92 Mb	Хр. 5: 123.31 – 123.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMD9 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 223 амінокислот, а молекулярна маса — 24 682.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDEEARQSG		GSSQAGVVTV		SDVQELMRRK		EEIEAQIKAN		YDVLESQKGI
GMNEPLVDCE		GYPRSDVDLY		QVRTARHNII		CLQNDHKAVM		KQVEEALHQL
HARDKEKQAR		DMAEAHKEAM		SRKLGQSESQ		GPPRAFAKVN		SISPGSPASI
AGLQVDDEIV		EFGSVNTQNF		QSLHNIGSVV		QHSEGKPLNV		TVIRRGEKHQ
LRLVPTRWAG		KGLLGCNIIP		LQR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12